Всего здесь можно встретить более 400 видов птиц, 17 из которых на побережье и островах образуют гнездовые колонии. Среди них есть птицы, занесённые в Международную Красную книгу. Одна из задач проводимых учётов - определить роль заповедника в охране птиц всего Залива. В 2019 году, благодаря Амурскому отделению WWF России, появилась возможность использовать методику картирования колоний некоторых видов птиц с помощью беспилотного летательного аппарата. Новый метод позволит наблюдать за птицами, не тревожа их. Российская наука получит более точные данные о популяции, уникальные фото и видео кадры.
- Регулярные орнитологические исследования в Заливе Петра Великого проходили с 1963 по 1968 и с 1979 по 1982 годы, - рассказали научные сотрудники Игорь Катин и Иван Тиунов. - Сегодня стоит задача - охватить учетом весь залив в течение одного гнездового сезона. Это необходимо для оценки изменений, которые произошли за 30-летний период. Эти данные должны стать основой дальнейшего мониторинга.
Залив Петра Великого расположен на стыке умеренной и субтропической зон. Эти условия определяют разнообразие видов животных и растений, обитающих здесь. В Заливе Петра Великого более 50 островов. В 1978 году наиболее интересные части залива включили в Морской заповедник.